เด็กอายุต่ำกว่า 2 ปีที่ใช้ยาปฏิชีวนะมีความเสี่ยงที่จะเป็นโรคหอบหืดในวัยเด็ก โรคภูมิแพ้ทางเดินหายใจ กลาก โรคอ้วนและโรคสมาธิสั้น การค้นพบนี้สอดคล้องกับสมมติฐานที่ว่าองค์ประกอบของไมโครไบโอม ซึ่งเป็นจุลินทรีย์ที่มีประโยชน์หลายล้านล้านชนิดที่อาศัยอยู่ในและในร่างกายของเรา มีบทบาทสำคัญในการพัฒนาภูมิคุ้มกันการเผาผลาญอาหารและพฤติกรรมในระยะเริ่มต้น

วิวัฒนาการของแบคทีเรียที่ดื้อยาเป็นตัวอย่างของผลกระทบที่ไม่ได้ตั้งใจจากการใช้ยาปฏิชีวนะมากเกินไป ความชุกของภาวะสุขภาพที่เพิ่มขึ้นในวัยเด็กทำให้เกิดความกังวลเกี่ยวกับการได้รับยาปฏิชีวนะในช่วงพัฒนาการที่สำคัญเนื่องจากผลกระทบต่อไมโครไบโอม ในขณะที่การศึกษาก่อนหน้านี้ได้ศึกษาความสัมพันธ์ของยาปฏิชีวนะกับโรคเดียว แต่นี่เป็นครั้งแรกที่พิจารณาความสัมพันธ์ในหลายโรค การศึกษาพบว่ายาปฏิชีวนะเกี่ยวข้องกับโรคเมตาบอลิซึม (โรคอ้วน การมีน้ำหนักเกิน) โรคภูมิคุ้มกัน (โรคหอบหืด การแพ้อาหาร ไข้ละอองฟาง และภาวะการรับรู้หรือความผิดปกติ (ADHD, ออทิสติก) แต่ผลจะแตกต่างกันไปตามยาปฏิชีวนะแต่ละชนิด ความเสี่ยงสูงสุดต่อโรคต่าง ๆ และออทิสติกและการแพ้อาหารโดยเฉพาะ